El primer mecanismo en la aparición del LES puede que
sea por predisposición genética. Las investigaciones indican que el lupus
eritematoso sistémico puede tener un vínculo genético. A pesar que el lupus corre en familias,
no se ha identificado un gen causal. De hecho, son varios los genes
que necesitan verse afectados para que aumente la predisposición del individuo
para desarrollar lupus, se ve afectada, con el contacto de factores
ambientales, y los genes más importantes se localizan en el cromosoma 16.
Estos genes pueden producirse aleatoriamente o ser el resultado de una
herencia. Además, quien sufre de LES presenta alterados los sitios vinculantes
del gen RUNX-1, que puede ser la causa o contribuir (o ambas cosas a la vez) a
este estado.
La alteración de los lugares vinculados del RUNX-1 también se ha
encontrado en pacientes con psoriasis y artritis reumatoide.
Otros genes que contienen variantes para el LES incluyen
- IRF5 el gen del interferón,
- PTPN22, STAT4, CDKN1A, ITGAM, BLK una tirosincinasa,
- TNFSF4 y BANK1 un regulador de la señalización celular.

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